小鼠种群管理
Labii 小鼠种群管理专为需要准确、端到端控制小鼠种群操作的研究团队而设计。该应用在一个集成系统中集中管理品系设置、单个小鼠记录、配对计划、窝产结果和笼位位置跟踪。通过将繁殖、血统和饲养数据整合在一起,团队可以减少人工错误,提高种群可见性,并在员工和研究之间标准化种群工作流程。
该应用支持繁殖管理、基因分型相关跟踪以及从亲本品系到后代的生命周期监控。团队可以查看活跃种群统计数据,自动计算世代,从窝产记录批量创建小鼠,并可视化血统关系,以做出更好的繁殖决策和研究规划。
小鼠种群管理还与 Labii 的存储和托管功能集成,用于笼位组织和处理可追溯性。了解更多请访问 小鼠种群管理落地页面。
应用场景
学术和转化研究种群
- 维护转基因、敲除和野生型品系的标准记录
- 按品系跟踪繁殖表现,以支持实验规划
- 监控血统和世代状态,以生成出版准备文档
- 协调多个项目和实验室成员之间的小鼠可用性
临床前和受监管的工作流程
- 为繁殖、窝产和动物移动事件维护可审计的记录
- 通过完整的活动历史支持与GLP对齐的文档实践
- 提高协议审查和内部质量检查的可追溯性
- 使笼位分配记录与繁殖和窝产更新同步
核心设施或共享动物资源管理
- 为多个主要研究者提供集中化的种群监督
- 标准化新品系和繁殖者的接收和编目
- 通过从窝产记录一键创建后代减少数据重复
- 改善动物工作人员、科学家和管理员之间的协调
基因型感知的种群规划
- 将基因型数据和种群元数据关联到每只小鼠记录
- 可视化血统以指导战略性配对并避免不必要的交配
- 基于活跃的交配和窝产进展预测种群容量
- 通过托管和存储记录跟踪下游使用和移动
应用数据模型
小鼠种群管理使用以下相互关联的表格:
- mc_mouseline:定义每个品系、品系级设置和汇总种群统计
- mc_mice:存储单个小鼠的身份、生命周期状态、血统参考和元数据
- mc_mating:跟踪繁殖事件、繁殖者、时间以及相关笼位和窝产
- mc_litter:捕获窝产结果、父母链接、窝产大小、世代和后代创建
- core_storage:跟踪笼位和物理存储位置层次结构
- core_chain_of_custody:记录处理和移动事件以实现可追溯性
您可以自定义表格字段、章节和小插件,以匹配您的品系命名法、基因分型模式和机构工作流程要求。
入门
在 Labii 的应用程序菜单中打开 小鼠种群管理。
配置基础设置:
- 定义小鼠品系命名标准和品系类别
- 设置默认生命周期里程碑(例如,断奶和成熟年龄)
- 确认小鼠、交配和窝产记录的状态选项
在 core_storage 中设置笼位和位置基础设施,以便小鼠、交配对和窝产可以分配到物理饲养位置。
审查用户权限,确保只有授权成员可以创建、更新或批准敏感的种群记录。
创建您的第一个小鼠品系并开始注册繁殖者和活跃种群小鼠。
核心工作流程
1) 配置小鼠品系和种群基准
使用此工作流程来建立每个小鼠品系并定义操作基准,以便在活跃繁殖之前进行设置。
导航到 mc_mouseline 并选择 添加新记录。
输入核心品系信息:
- 品系名称和类别
- 主要基因型描述符
- 状态(活跃、归档或计划中)
- 断奶和成熟年龄设置
保存记录并验证品系级别的统计面板,查看活跃小鼠、活跃交配和活跃窝产。
2) 注册单个小鼠并跟踪血统
使用此工作流程为每只动物创建高质量、可追溯的记录。
导航到 mc_mice 并创建新的小鼠记录。
捕获识别和生物学细节:
- 小鼠标识符和性别
- 出生日期或估计年龄
- 当前状态和品系分配
- 基因型和相关元数据
在可用的情况下链接父母或血统关系,以支持系谱可视化。
使用链接的存储数据分配笼位位置,使饲养与动物记录保持同步。
3) 管理繁殖和交配记录
使用此工作流程来跟踪配对并保持繁殖可追溯性。
打开 mc_mating 并创建新的交配事件。
选择繁殖小鼠(单个或多个繁殖者,根据您的工作流程配置)。
记录交配细节:
- 开始日期
- 笼位分配
- 交配状态和备注
- 相关小鼠品系上下文
保存记录并监控添加的关联窝产结果。
4) 记录窝产并批量创建后代
使用此工作流程快速将繁殖结果转换为结构化的动物记录。
导航到 mc_litter 并创建与交配事件关联的窝产记录。
输入窝产详情:
- 父母参考
- 出生日期
- 窝产大小
- 笼位分配
- 健康状况或观察的备注
查看自动计算的世代值。
点击 创建小鼠 以根据窝产大小自动生成单个后代记录。
在数据可用时,更新每个后代记录的性别、基因型结果和生命周期状态。
5) 跟踪笼位位置和托管事件
使用此工作流程来保留饲养和移动可追溯性,以确保合规性和操作清晰度。
使用 core_storage 定义笼位层次结构(设施、房间、架、笼)。
将存储位置分配给小鼠、交配对和窝产。
在 core_chain_of_custody 中记录笼位转移、处理交接或移动事件。
在审计、协议检查和事件调查期间审查移动历史。
高级功能
流程集成用于种群生命周期自动化
Labii 流程集成可以协调常见的种群事件,包括交配启动、窝产更新、断奶转换和状态更改。
使用工作流程步骤和自动化规则来减少重复的数据输入,并在团队之间强制执行一致的种群程序。
自动世代计算
在窝产工作流程中自动计算世代,以减少人工错误并保持血统记录的一致性。
血统可视化
血统工具为每只小鼠提供类似系谱的上下文,帮助团队做出明智的繁殖和基因分型决策。
灵活的数据自定义
所有主要表单都可以调整以捕获研究特定的元数据,如基因型调用方法、表型标签和协议标识符。
故障排除
问题:窝产中未创建后代记录
症状:创建小鼠操作未生成预期的小鼠记录。
验证窝产记录中窝产大小是否输入为有效的数字值。
确认窝产已保存并链接到有效的交配记录。
检查在 mc_mice 中创建记录的用户权限。
重试 创建小鼠 并确认在小鼠列表视图中记录的创建。
问题:笼子位置在记录中显示不一致
症状:小鼠、交配或一窝记录显示的饲养位置与预期不符。
确认 core_storage 中的存储层级值处于激活状态,而非归档状态。
查看 core_chain_of_custody 中的最近移动记录,检查是否有更新或转移。
标准化位置更新规则,确保在转移时所有相关记录都得到更新。
问题:谱系视图不完整
症状:谱系可视化中缺少父母或后代关系。
检查小鼠和一窝记录中的父母引用是否正确填写。
确认记录链接到同一组织,并且在激活范围内可用。
保存关系更新后,重新加载记录详情页面。