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化学

概述​

以下是与化学相关的列小插件列表。

化学结构​

使用此小插件从化学绘图章节显示化学结构。该小插件无法创建或绘制化学结构,只能显示来自化学绘图章节的化学结构。

只读视图:

小插件列化学结构只读

编辑视图:

小插件列化学结构编辑

表单视图:

不支持

配置

{
"should_auto_update": false, # (optional), default to false.
# If true, the widget will perform live calculation
# If false, the user have to click reload to update the value
"should_auto_update_when_empty": true, # (optional), default to true.
# If true, the widget will perform live calculation when the data is empty
# If false, the results will not be calculated on default
}

导入值:

不支持

SMILES结构​

此小插件使用Smiles Drawer从SMILES绘制化学结构。

只读视图:

小插件列SMILES结构只读

点击“生成SMILES”按钮,根据化学名称生成分子量。

编辑视图:

小插件列SMILES结构编辑

表单视图:

与编辑视图相同。

配置:

不支持

导入值:

SMILES字符串。

分子式​

此小插件可以:

  1. 从名称生成分子式
  2. 生成分子量
  3. 生成SMILES(简化分子输入线性输入系统)
  4. 生成分子结构

使用此小插件之前,需要先创建以下列。默认情况下,这些列会在化学表中自动创建。

  • molecular_weight
  • SMILES
  • molecular_structure

此小插件使用了chemcalc的一些功能。

ChemCalc:未来化学基础设施的构建模块。Patiny, Luc; Borel, Alain 《化学信息与建模杂志》2013年。DOI:10.1021/ci300563h

点击 生成公式 按钮,可以直接从名称获取分子式。您也可以点击 编辑 按钮手动输入分子式。

编辑视图:

只读视图:

点击 生成数据 按钮生成分子量、SMILES和分子结构。

表单视图:

与编辑视图相同

配置:

{
"should_use_mw": false, # optional, if false, nominal mass will be used.
"molecular_weight": {"sid":"xxx", "name":"xxx"},
"SMILES": {"sid":"xxx", "name":"xxx"},
"molecular_structure": {"sid":"xxx", "name":"xxx"}
}

导入值:

公式字符串。